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En cualquier otro contexto, no habría sido notable: el domingo 28 de noviembre, un residente de San Francisco que se había sentido levemente enfermo tomó una prueba de Covid. Al día siguiente, salió positivo.
Sin embargo, lo que hizo sonar las alarmas fue que el residente había regresado recientemente de Sudáfrica, donde la variante Omicron recién descubierta estaba muy extendida.
La muestra de prueba del viajero se marcó para una secuenciación genómica prioritaria, que revelaría el código genético preciso del virus que había infectado al viajero y si tenía las mutaciones reveladoras de Omicron.
El Dr. Chiu, el microbiólogo de San Francisco, fue elegido para realizar la secuenciación. A las 6 pm del martes 30 de noviembre, solo unas horas después de que el Dr. Chiu se enteró por primera vez de la muestra, se la entregó en mano a su laboratorio, empaquetada en hielo seco.
El Dr. Chiu y sus colegas se pusieron a trabajar rápidamente. Aunque generar la secuencia completa lleva horas, los científicos optaron por utilizar una técnica conocida como secuenciación de nanoporos, que les permitió analizar los resultados en tiempo real, mientras el proceso aún estaba en curso.
«A medida que se acumularon los datos, pudimos identificar más y más mutaciones», recordó el Dr. Chiu.
Antes del amanecer, estaba seguro: era Omicron, el primer caso encontrado en Estados Unidos. Había pasado menos de una semana desde que Sudáfrica anunció públicamente por primera vez la existencia de la variante.
No podemos luchar contra lo que no podemos ver, y la prevención de la próxima pandemia comienza con la detección y seguimiento de los patógenos que nos amenazan. En ese sentido, al menos, «estamos extraordinariamente mejor que en esta época el año pasado», dijo Joseph Fauver, epidemiólogo genómico del Centro Médico de la Universidad de Nebraska en Omaha.
Fuente:nytimes.com/
